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如何选择专业可靠的基因检测公司?

作者:干细胞资讯网 56℃ 0评论

如何选择专业可靠的基因检测公司?这个文章是写给患者跟医生的。很多医院患者做基因检测选择哪个公司是没有选择权的,基因检测在很多癌种中能给患者带来实际的临床获益,一些医生也在筛选检测公司。 作为行业的从业者,每个人都有自己的衡量标准,这里浅谈自己的一些评判标准。 肿

    如何选择专业可靠的基因检测公司?

这个文章是写给患者跟医生的。很多医院患者做基因检测选择哪个公司是没有选择权的,基因检测在很多癌种中能给患者带来实际的临床获益,一些医生也在筛选检测公司。

    作为行业的从业者,每个人都有自己的衡量标准,这里浅谈自己的一些评判标准。

    肿瘤的基因检测,哪些公司的检测质量是靠谱的呢?

    1.我看一个公司,首先会搜一下这个公司发表的文章,包括ASCO等会议摘要,可以粗略的把50篇-100篇作为一个标准,当然这里说的50篇是要跟公司业务相关的,有些仅仅是挂名的,对公司的业务没有实际作用的灌水文章要剔除,有些是找的国外顾问,一年花费不菲的顾问费,所有作者都是老外,仅仅因为顾问的原因挂名的文章也剔除掉。

    2.文章的数量达标了,是否就靠谱,并非如此。我会具体看看他们文章中测序业务相关的文章中入组患者的人数,如果一个公司很多文章入组人数特别多。比如千人,万人。一般的公司搞个千人,万人,整理这些患者数据公司完全吃不消,因为测序的时候患者信息太不全,销售不愿意收集,公司也不强求。后期再收集患者数据困难很大。自动化程度如果再低一些,那处理千人的信息,简直就是灾难。

    3.基因检测公司要发文章是需要时间积累的。经过几年的发展,有前面的积累,这两年可以看到比较不错的公司,厚积薄发,文章越发越高,频率比之前也高了很多。而并不怎么靠谱的公司,缺少这种积累,后面发文章反而会成为一种负担。有些公司文章没发出来呢,就各种吹了。文章呢?过一年半载可能都见不了刊。落袋为安,文章发表了,见刊了才算。没发表的,都是虚的。

    4.有些公司做检测连病理病史的报告都不确认,这种公司呵呵呵了。对患者不负责任,对公司未来的发展,恐怕也是走市场和销售路线,这种公司对质量要求不会太高。这种公司发文章是比较困难的,发的文章入组人数一般都在200人以内,因为再多,公司负担太重了。

    文章是一面照妖镜,报告模板还有市场策略,各家公司模仿或者抄袭起来太容易,而文章数量跟质量,是模仿不来的。

    5.我会看看行业内的公司国内外的大会展现的内容,我会看连续两年或者三年的内容的变化。会有一些有意思的事情?有些公司两三年讲解的内容基本没有变化,一年的时间他们没干什么正事?有些公司总是吹鼓积累了多少例样本。但是数据展示在哪里?从积累的几万例或者几千例的样本中得到了什么,却不谈。找相关的文章,也没有。这种公司包装的是一流的。

    6.每家公司都在吹自己的生物信息多么牛,怎么看到底牛不牛呢?我的方法很简单,还是看文章还是看他们公司在大会上展示的内容。文章检测结果到底怎么样?常见的点突变很难对比出来,但是融合和长缺失,大部分公司是短板。通过几份报告是难以看出来这种细微的差别。但是通过公司展示的数据或者发表的文章可以看出端倪,很多癌种中都有融合,看看他们的数据中,有多少涉及融合,很多公司并没有融合。有的公司好不容易展示一个长缺失,反复展示好几次。正经公司展示出来的数据不会只有个案。生信真的牛,大会上有些公司会把融合和长缺失的数据作为重点展示。

    7.再说一下新鲜的东西,比如新抗原或者是甲基化,有些公司这些方向是重点,但是有些公司只是一个噱头。别人有,我也有。看看他们公司的主页,看看他们平时公总号分享的文章就大概清楚是不是公司主要要干的事情。

    8.报告排版就不细说了,国内公司主要模仿国外公司,国内公司又互相模仿。模仿起来很快,成本又低。

    9.报告内容。有的公司内容很简单,有些内容很多。内容简单的可能是公司有内容不展示,也可能是公司就一套死的模板,想展示也展示不出来,没展示的能力。

    10.很多人吐槽各家公司的报告,确实有很多问题。内行的看门道,外行的看热闹。有些能暴露公司的一些问题。但根本的东西我觉得还是在上游的问题。通过一份报告来否定一家公司,我觉得可以排除末尾的公司,但是行业内靠前的公司,有时候并不能盲目的下论断。因为排版内容合家会互相模仿的。

    11.有些人把一个样本送两家或三家去检测,检出的觉得靠谱,其实未必。每家公司用的生信软件有差异,有很大的偶然性。而且报的多的未必就好,有些公司缺少严格的假阳性的优化流程,或者阈值调低,都会让检出率有所提高。

    12.之前对小公司并无好感,接触过几个小公司的人和公司,有些还是可以的,但小公司的资源太有限,能活下来也相对困难,筛选起来难度加大,暂不做讨论。

    13.还有很多方面,干这行时间久了,会有大致的轮廓。


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